Our Science GR

Πρόγραμμα ταξινόμησης myVision® – Myriad Variants

Η ταξινόμηση παραλλαγών είναι ένα βασικό συστατικό του ελέγχου των γεννητικών γραμμών, επιτρέποντας στους ασθενείς να έχουν μια ακριβή απάντηση όταν λαμβάνουν ένα αποτέλεσμα και να παραμένουν ενήμεροι καθώς οι νέες πληροφορίες οδηγούν σε αναταξινόμηση. Δεν στέλνουν όλα τα εργαστήρια τροποποιημένες αναφορές ή έχουν ποικίλα προγράμματα ταξινόμησης, οδηγώντας σε κενό στη φροντίδα των ασθενών. Η ύπαρξη ενός ισχυρού προγράμματος ταξινόμησης παραλλαγών με πολλά εργαλεία για την ταξινόμηση και την επαναταξινόμηση των παραλλαγών είναι ζωτικής σημασίας για την παροχή του υψηλότερου επιπέδου φροντίδας των ασθενών.

Ταξινόμηση Myriad: Παραλλαγή αβέβαιης σημασίας (VUS)

Αναγνωρίζουμε ότι τα αποτελέσματα χρησιμοποιούνται για αποφάσεις που αλλάζουν τη ζωή, επομένως δίνουμε προτεραιότητα στην ακρίβεια έναντι της ταχύτητας στις ταξινομήσεις:

• Η Myriad απαιτεί όριο εμπιστοσύνης 99% για ταξινομήσεις
• Απαιτούνται πολλές αποδείξεις για ταξινομήσεις
• Δέσμευση για επανακατάταξη δια βίου: τροποποιήθηκε

myVision®: Το ασύγκριτο πρόγραμμα ταξινόμησης παραλλαγών της Myriad

Το myVision® ενσωματώνει πολλά ιδιόκτητα, κλινικά επικυρωμένα εργαλεία, καθώς και άλλες προηγμένες μεθόδους για την παροχή του πιο ολοκληρωμένου διαθέσιμου προγράμματος ταξινόμησης παραλλαγών.

Βελτιωμένες μέθοδοι από Myriad

• Literary Review: Η Myriad διαθέτει μια αυτοματοποιημένη μηχανή αναζήτησης βιβλιογραφίας και απασχολεί ειδικούς επιστήμονες επιπέδου PHD για να αναθεωρήσει τη βιβλιογραφία1
• Ανάλυση πληθυσμού και ανάλυση διαχωρισμού: Η βελτιστοποιημένη προσέγγιση του Myriad όπως περιγράφεται στο Eggington, 20132
• Στο Trans Co-Occurrence & amp; Ομοζυγωτικότητα: Αποδείχθηκε ότι είναι & 99% ακριβής στο Fernandes, 2015
• Ανάλυση δομικής βιολογίας: Η προσέγγιση του Myriad που περιγράφεται στο Kerr, 20164
• Λειτουργική ανάλυση RNA Splice Site: Myriad ανέπτυξε το πρώτο ερευνητικό εργαστήριο αφιερωμένο στην ανάλυση RNA, η προσέγγιση του οποίου περιγράφεται στο Warf, 20155

Προηγμένες μέθοδοι Μοναδικές σε Myriad

• M-CO ™: Το μοναδικό στατιστικό μοντέλο συνύπαρξης μετάλλαξης της Myriad αναπτύχθηκε και επικυρώθηκε με & gt; 400.000 ασθενείς και αποδείχθηκε ότι ήταν & gt; 99% ακριβές στο Coffee, 2015
  ⁶
• Pheno ™: Το μοναδικό εργαλείο στάθμισης οικογενειακού ιστορικού της Myriad αναπτύχθηκε και επικυρώθηκε για BRCA 1/2, MLH1, MSH2, MSH6, ATM, CHEK2, PALB2 και BARD1. Αποδείχθηκε ότι είναι 99% ακριβής σε πολλές δημοσιεύσεις^7-9

Το myVision® είναι μια δέσμευση ζωής για τους ασθενείς, με αναθεώρηση παραλλαγών και ενημερωμένες τροποποιημένες αναφορές που αποστέλλονται στους ασθενείς καθημερινά¹⁰

• 60.000+ τροποποιημένες αναφορές μεταξύ 2006 και 2016
• 2.868 παραλλαγές που επαναταξινομήθηκαν μεταξύ 2006 και 2016
• Το 9% αυτών των ανακατατάξεων επηρέασε τη συνιστώμενη ιατρική διαχείριση

Myriad’s myVision^™:Το πρόγραμμα ταξινόμησης παραλλαγών θεωρείται το χρυσό πρότυπο στη βιομηχανία

• Απασχολούμε πάνω από 30 ιατρικούς επαγγελματίες διαφόρων ειδικοτήτων που συναντιούνται καθημερινά για να ταξινομήσουν και να επαναταξινομήσουν παραλλαγές
• Χρησιμοποιούμε 8 δημοσιευμένες και αξιολογημένες μεθοδολογίες, 2 μοναδικές για το Myriad που έχουν & gt; 99% PPV ή NPV
  ^(11,12,13)
• Κατατάξαμε πάνω από 10.000 παραλλαγές το 2016 και στείλαμε πάνω από 400 αποτελέσματα αναταξινόμησης στους παρόχους κάθε εβδομάδα
• Ισόβια δέσμευση για ταξινόμηση:
   Θα παρέχουμε σε εσάς και στους ασθενείς σας ένα ενημερωμένο αποτέλεσμα εάν μια παραλλαγή επαναταξινομηθεί, ανεξάρτητα από το πότε έγινε ο αρχικός έλεγχος

Η Myriad διαθέτει μια ομάδα εμπειρογνωμόνων που συμμετέχει στην ταξινόμηση παραλλαγών, με την αναθεώρηση να πραγματοποιείται καθημερινά.

βιβλιογραφικές αναφορές:

1. Esterling, L, et al. ASHG 2015.
2. Eggington J, et al. Clinical Genetics 2013.
3. Fernandes P, et al. ACMG 2015.
4. Kerr I, et al. International Symposium on HBOC 2016.
5. Warf B, et al. International Symposium on HBOC 2016.
6. Coffee B, et al. ACMG 2015.
7. Pruss D, et al. Breast Cancer Research and Treatment 2013.
8. Morris B, et al. BMC Genetics 2016.
9. Bowles K, et al. ACMG 2016.
10. Mersch J, et al. JAMA 2018.
11. Pruss D et al. Development and validations of a new algorithm for the reclassification of genetic variants identified in the BRCA1 and BRCA2 genes; Breast Cancer Research and Treatment. 2013
12. Morris B et al. Classification of genetic variants in genes associated with Lynch syndrome using a clinical history weighting algorithm; BMC Genetics. 2016
13. Bowles K et al. Reclassification of uncertain variants in high and moderate cancer risk genes using history weighting analysis; ACMG. 2016

Laboratories Approaches Vary

“As commercially available tests differ in the specific genes analyzed (as well as classification of variants and many other factors), choosing the specific laboratory and test panel is important.”

– NCCN Guidelines Version 1.2016 Genetic/Familial High-Risk Assessment

“The processes by which different laboratories assure the analytic and clinical validity and clinical utility of the sequence variants identified by their NGS analyses may vary… variable methods of interpretation and reporting of the clinical significance and actionability of variants could lead to compromises in patient care.”¹

1. Robson, et al. Journal of Clinical Oncology 2015

ACMG Guidelines are NOT a definitive variant classification program, and “following” the guidelines does not quantify a lab’s interpretive accuracy.¹

1. Richards S, et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet Med. 2015 May;17(5):405-24.

Public databases and less accurate techniques, such as in silico prediction models like SIFT and PolyPhen, are NOT used as part of the Myriad variant classification program due to published data demonstrating their inaccuracy.

Classifications differ between laboratories

 Not only are professional organizations recognizing the discordance between laboratories but multiple peer-reviewed publications have documented a wide range (8.3%-40%) of variance that could impact critical decision making for appropriate patient care.